Alejandro Jodorowsky wurde am 17. Februar 1929 in Tocopilla, Chile geboren. 1939 zog er nach Santiago, wo er die Universität besuchte, als Zirkusclown und Puppenspieler arbeitete. 1953 ging er nach Paris und studierte Pantomime bei Marcel Marceau. Dort arbeitete er mit Maurice Chevalier und drehte einen Kurzfilm, La cravate (1957). Er freundete sich zudem mit den Surrealisten Roland Topor und Fernando Arrabal an und gründete mit ihnen 1962 die "Panikbewegung" zu Ehren des mythischen Gotts Pan. Im Rahmen dieser Gruppe verfasste Jodorowsky mehrere Bücher und Theaterstücke. In den späten 1960er Jahren inszenierte er avantgardistisches Theater in Paris und Mexiko-Stadt, kreierte den Comic-Strip "Fabulas Panicas" und drehte seinen ersten "echten" Film, die surrealistische Liebesgeschichte Fando and Lis (1968), basierend auf einem Stück von Arrabal. 1971 wurde El Topo (1970) veröffentlicht und avancierte zum Kultfilm, ebenso wie Montana Sacra - Der heilige Berg (1973). 1975 kehrte er nach Frankreich zurück, um die Arbeiten an einem nie realisierten Filmprojekt zu beginnen: einer kolossalen Adaption von Frank Herberts "Dune", die u.a. mit Orson Welles und Salvador Dalí besetzt und von Pink Floyd vertont werden sollte. Dieses Projekt vereinte die visionären Talente von H.R. Giger, Dan O'Bannon und 'Jean "Moebius" Giraud' (Giger und O'Bannon arbeiteten später zusammen an Alien: Das unheimliche Wesen aus einer fremden Welt (1979)). Die Finanziers des Projekts zogen sich jedoch zurück, und "Dune" wurde schließlich von David Lynch verfilmt. Jodorowskys nächster Film war Tusk (1980), eine Geschichte über die Freundschaft eines jungen Mädchens mit einem Elefanten, der jedoch schnell in Vergessenheit geriet. In den frühen 1980er Jahren begann er mit Moebius und anderen Künstlern an verschiedenen Comic-Strips, Graphic Novels und Cartoons zu arbeiten und schrieb weitere Bücher. Mit Santa Sangre (1989) kehrte er zum Film zurück, der bei Kritikern auf große Anerkennung stieß und weite Verbreitung fand. 1990 führte er bei dem Fantasy-Film The Rainbow Thief (1990) mit Omar Sharif und Peter O'Toole Regie. Im Laufe der 1990er Jahre produzierte er weiterhin Cartoons mit verschiedenen Grafikkünstlern und soll Berichten zufolge im Jahr 2002 oder 2003 mit den Arbeiten an einem weiteren Film, dem lang erwarteten "Sons Of El Topo", beginnen. Jodorowskys Ehefrau Valerie und seine Söhne Brontis, Axel und Adan sind zu verschiedenen Zeiten in seinen Filmen aufgetreten.
